Baseino švaros palaikymas yra labai svarbus siekiant užkirsti kelią ligų plitimui, išvengti nelaimingų atsitikimų ir užkirsti kelią infekcijoms. Visapusišką baseino valymą rekomenduojama atlikti bent kartą per savaitę, ypač dažno naudojimo sezonais. Reguliarus valymas apima ne tik filtrų rutulių plovimą, bet ir vandens kokybės patikrinimą, baseino sienų ir grindų bei kitos įrangos, pvz., siurblių ir filtravimo sistemų, valymą.